สำนักข่าวต่างประเทศรายงานว่า ญี่ปุ่นยังเผชิญเหตุอาฟเตอร์ช็อคอย่างต่อเนื่องในหลายพื้นที่ ล่าสุดเมื่อเวลา 12.52น.ตามเวลาท้องถิ่นวันที่ 16มีนาคม เกิดอาฟเตอร์ช็อคขนาด 6 ริคเตอร์ที่จังหวัดคันโต แต่ยังไม่มีการประกาศเตือนภัยคลื่นสึนามิ ขณะที่จังหวัดชิบะเกิดอาฟเตอร์ช็อคในระดับความรุนแรงเกือบ 6 ริคเตอร์ ขึ้นเช่นกัน แรงสั่นสะเทือนสามารถรู้สึกได้ในพื้นที่ใจกลางกรุงโตเกียวและทำให้อาคารสูงหลายแห่งสั่นไหว คาดว่าศูนย์กลางของอาฟเตอร์ช็อคดังกล่าวอยู่ที่ใต้ทะเลในระดับความลึก 10 กิโลเมตร นอกชายฝั่งของจังหวัดชิบะ
ทากาชิ โยโกตะ ผู้อำนวยการกองพยากรณ์และข้อมูลแผ่นดินไหว กรมอุตุนิยมวิทยาญี่ปุ่น ได้เตือนไว้ตั้งแต่วันที่ 13มีนาคมเว่า มีความเป็นไปได้ 70% ทีจะเกิดอาฟเตอร์ช็อคความรุนแรงระดับ 7 หรือมากกว่านั้นภายในวันที่ 16 มีนาคม แรงสั่นสะเทือนระดับ 7 สามารถทำลายอาคาร และก่อให้เกิดสึนามิระลอกใหม่ได้